Las siguientes son las instituciones con las cuales el Hospital Materno Infantil San Roque ha celebrado Convenio Marco de Trabajo, mediante resoluciones del Ministerio de Salud de la Provincia de Entre Ríos:
Universidad Nacional de Entre Ríos
- Facultad de Ciencias de la Salud
- Ingeniería
Universidad Autónoma de Entre Ríos
- Facultad de Ciencias de la Vida y Salud
Cruz Roja Instituto Superior D-74, Paraná
Universidad Nacional de Rosario
- Facultad de Ciencias Médicas
Universidad Nacional del Litoral
- Facultad de Medicina
- Facultad de Bioquímica
Universidad Adventista del Plata
Instituto Madre Teresa de Calcuta